Les travaux de vérification ont pu relever des obsevations relatives à l'élaboration du programme, au financement des troisième et quatrième générations du programme et à la mise en œuvre des composantes du programme dans le cadre de la troisième et de la quatrième génération.

L'audit de la Cour a porté sur l'évaluation de l'efficacité du commissariat durant la période 2004-2009 dans la mobilisation des ressources hydrauliques, la préservation du sol, la gestion des zones publiques irriguées, l'exécution des projets agricols et dans sa gestion financière.

les travaux de contrôle ont couvert la période du 10 éme plan de développement et les années 2007 et 2008  et ont porté sur le cadre juridique des projets régionaux, les mécanismes de transfert de crédit et l'exécution d'un échantillon de projets.